Allelic variation of the 5-HTT Gene in Macaca nemestrina

Nama : Ikka Erniasari       G34051374
Pembimbing : RR Dyah Perwitasari Achmad Farajallah
Tanggal Lulus : 25-Jan-10
Judul Thesis : Variasi Alel dari Gen 5-HTT (Penyandi Agresivitas) pada Macaca nemestrina
    Allelic variation of the 5-HTT Gene (Encoding Aggresivity) in Macaca nemestrina
Abstrak:
Macaca nemestrina merupakan jenis primata yang agresif. Agresivitas ini dipengaruhi oleh berbagai faktor di antaranya oleh gen. Gen yang berperan yaitu 5-HTT yang merupakan penyandi transporter serotonin yang bekerja meregulasi sistem serotonergik dan reseptornya melalui modulasi konsentrasi serotonin di dalam cairan ekstraselular. Variasi yang terjadi pada daerah promotor dan intron dapat mengubah regulasi transkripsi gen 5-HTT. Variasi ini terutama dapat mengurangi ekspresi dari transporter dan pengambilan serotonin. Perubahan ekspresi dari transporter dapat berpengaruh terhadap agresivitas, emosi, fungsi motorik dan beberapa sifat kognitif pada primata. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman gen 5-HTT (penyandi agresivitas) pada M. nemestrina. Sampel yang digunakan adalah 56 ekor M. nemestrina yang berasal dari satu kelompok. Amplifikasi gen 5-HTT dilakukan secara in vitro dengan menggunakan metode Polymerase Chain Reaction (PCR). Amplifikasi di daerah promotor menunjukkan adanya variasi yang diwakili oleh dua macam alel dan tiga macam genotip dengan frekuensi alel L sebesar 88,18% dan 11,82% untuk alel S. Sementara variasi pada daerah intron 3 diwakili oleh alel l dan s dengan frekuensi masing-masing sebesar 55,4% dan 44,6%. Tidak ditemukan adanya genotip s/s pada daerah intron 3. Alel S merupakan alel yang dominan terhadap alel L, keberadaaan dari setidaknya satu macam alel S dapat menyebabkan penurunan aktivitas transkripsi. Amplifikasi daerah promotor menghasilkan satu individu dengan genotip S/S yang kemungkinan merupakan jantan alfa dalam kelompok ini.
Abstract:
Macaca nemestrina is an aggressive primate. The aggresivity is influenced by many factors, one of them is by a gene. The 5-HTT gene encodes the serotonin transporter that affects the regulation of serotonergic system and its receptor by modulating the concentration of serotonin in extracellular fluid. Variation in promoter and intron region can change the transcriptional activity of the 5-HTT gene, mainly the activity of the transporter and serotonin uptake. The transporter change activity influenced aggressivity, emotion, motor function, and some cognitive traits in primates. This research aimed to determine alelles variant of 5-HTT gene (encoding aggresivity) in M. nemestrina. Samples used in this research consisted of 56 M. nemestrina. The gene was amplified by the Polymerase Chain Reaction (PCR) method. Amplification in promoter region revealed two alleles and three genotypes with the frequencies of L and S alleles were 88,18% and 11,82%, respectively. Amplification of the third intron region showed two alleles with the frequency of l and s alleles were 55,4% and 44,6%, respectively. None of the individual had s/s genotype in the third intron region. Short allele was dominant to long allele. The presence of at least one short allele decreased transcription activity. There was one individual with S/S genotype in promoter region that was possibly to be the alpha male in the group

[ Skripsi Lengkap – fulltext ]

 

No Comment

Comments are closed.