Analisis Keragaman Genetik Kura-Kura Air Tawar (Cuora amboinensis)

 

Nama : Ine Dewi Lestary (G04497023)
Pembimbing : Achmad Farajallah
Pembimbing : Bambang Suryobroto
Tanggal Lulus : 9 Oktober 2001
Judul Skripsi : Analisis Keragaman Genetik Kura-Kura Air Tawar (Cuora amboinensis) (Testudines: Emydidae) Berdasarkan Haplotipe mtDNA
Genetic Diversity of mtDNA of Freshwater Turtle
Abstrak : Cuora amboinensis merupakan kura-kura air tawar yang termasuk ke dalam ordo Testudines, famili Emydidae dan subfamili Batagurinae. C. amboinensis memiliki penyebaran geografis yang luas, namun tidak ada variasi subspesies yang dapat digambarkan. Selain itu keberadaan C. amboinensis saat ini terancam punah. Oleh karena itu perlu diadakan penelitian untuk mengetahui keragaman genetik spesies ini. Salah satu caranya adalah dengan menggunakan penanda molekular genom mitokondria. Keragaman genetik mtDNA dapat diketahui melalui penggandaan in vitro sampel DNA secara selektif. Bagian yang digandakan bermula dari Cyt b hingga bagian tengah daerah pengendali. Produk yang dihasilkan dari proses penggandaan (880 pasang basa) dipotong menggunakan lima enzim restriksi (MspI, TaqI, MboI, HaeIII dan HhaI). Pemotongan ini menghasilkan tujuh haplotipe. Dari tujuh haplotipe diperoleh keragaman nukleotida C. amboinensis sebesar 9.6%. Hal ini berarti keragaman nukleotida C. amboinensis (9.6%) lebih tinggi dari Dogania subplana (6.9%) dan Simpanse (1.3%).
Abstract : Cuora amboinensis is a freshwater turtle belongs to order  Testudines, Family Emydidae and subfamily Batagurinae. C. amboinensis has a wide geographical distribution, but there is no subspecies variation that can be described.  At the moment the existance of C. amboinensis is in the danger of extinction. Thus it is important to carry a research in the genetic diversity of this species.  One of the methods is using mitochondrial genome (mtDNA) as a marker.   The genetic  diversity of mtDNA can be obtained using the in vitro amplification of the selected area.   The selected region is a segment spanning the region of  cyt b through the middle part of the control region.  The product of the  amplification (880 base pairs) was cut  using five restriction enzymes (MspI, TaqI, MboI, HaeIII and HhaI) . The cutting produce seven haplotypes.  Diversity of these haplotypes is 9.6%, indicating that C. amboinensis is more diverse than Dogania subplana (6.9%) and Simpanse (1.3%).

Full text

No Comment

Comments are closed.