Gene Variation 5-HTT on Sumatran Orangutan

Nama : Chyntia Dessy Lestari Ambarwati  G34070005
Pembimbing : RR Dyah Perwitasari Achmad Farajallah
Tanggal Lulus : 8 November 2011
Judul Skripsi : Variasi Alel Gen 5-HTT Penyandi Agresivitas pada Orangutan Sumatera (Pongo abelii)
  Gene Variation 5-HTT Allele Coding Aggressiveness on Sumatran Orangutan (Pongo abelii)
Abstrak:
Orangutan Sumatera (Pongo abelii) merupakan kera besar yang daerah persebarannya hanya di Asia. Hewan ini merupakan primata yang agresif. Agresivitas dipengaruhi oleh berbagai faktor, diantaranya oleh gen. Gen yang berperan yaitu gen 5-HTT yang merupakan penyandi transporter serotonin yang bekerja meregulasi sistem serotonergik dan reseptornya melalui modulasi konsentrasi serotonin di dalam cairan ekstraselular. Variasi yang terjadi pada daerah intron dapat mengubah regulasi transkripsi gen 5-HTT. Perubahan ekspresi dari transporter dapat berpengaruh terhadap agresivitas, emosi, fungsi motorik dan beberapa sifat kognitif pada primata. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman gen 5-HTT pada P. abelii. Sampel yang digunakan sebanyak 48 sampel yang terdiri dari 28 jantan dan 20 betina. Amplifikasi gen 5-HTT dilakukan secara in vitro dengan menggunakan teknik PCR. Frekuensi genotipe L/L 23.81 %, L/S 47.62 %, dan S/S 28.57%. Frekuensi alel L 0.48 dan alel S 0.52. Amplifikasi sampel Macaca nemestrina dilakukan untuk membandingkan ukuran fragmen amplikon gen 5-HTT pada monyet dan kera besar. Sampel P. abelii nomor 127 (S/S) dan 131 (L/L) dan sampel M. nemestrina nomor 12, 38, dan 39 menunjukkan kemiripan sebesar 99% dengan gen transporter serotonin manusia pada kromosom 17 dengan nomor aksesi NG_011747.1. Individu bergenotipe L/L mengekspresikan serotonin dua kali lebih banyak daripada individu bergenotipe S/S atau L/S. Alel S memiliki aktifitas transkripsi yang rendah dibandingkan alel L.
Abstract:
Sumatran orangutan (Pongo abelii) is a great apes inhabiting Asia. This animal is an aggressive primates. Aggressiveness is influenced by various factors, including the genes. Genes that play a role is 5-HTT gene coding for the serotonin transporter, which is working to regulate the serotonergic system and its receptors via modulation of the concentration of serotonin in the extracellular fluid. Variations that occurred in the intron may alter the regulation of 5-HTT gene transcription. Changes in expression of the transporter can influence the aggressiveness, emotion, motor function and some cognitive properties in primates. This study aimed to identify the diversity of 5-HTT gene on Sumatran orangutans in among 48 samples consisting of 28 males and 20 females. 5-HTT gene amplification was performed in vitro using PCR techniques. Frequency of genotype L/L, L/S, and S/S were 23.81%, 47.62%, and 28.57% respectively. The frequency of allele L was 0.48 and allele S was 0.52. Amplification of Macaca nemestrina samples aimed to compare the size of the amplicon fragments 5-HTT gene between monkeys and great apes. Samples of P. abelii number 127 (S/S) and 131 (L/L) and samples of M. nemestrina number 12, 38, and 39 showed 99% similarity to human serotonin transporter gene on chromosome 17 with the accession number NG_011747.1. Individuals with L/L genotype express two times more serotonin than individuals with S/S genotype. The S allele has a low transcriptional activity than allele L.

[ Skripsi Lengkap – fulltext ]

No Comment

Comments are closed.