Posted December 31, 2013 Comments Off on Identifikasi Ragam gen Prolifikasi pada Domba Garut
| Nama |
: |
Nur Azifah Cakra Dewi G34053528 |
| Pembimbing |
: |
Achmad Farajallah |
Cece Sumantri |
| Tanggal Lulus |
: |
14-Aug-09 |
| Judul Thesis |
: |
Identifikasi Ragam Gen Bone Morphogenic Protein Receptor IB (BMPR-IB) dan Gen Bone Morphogenic Protein 15 (BMP15) Terhadap Prolifikasi pada Domba Garut Galur Subur |
| |
|
Identification in Bone Morphogenetic Protein Receptor IB (BMPR-IB) and Bone Morphogenetic Protein 15 (BMP15) Genes are Associated with Proliferation in Prolific Garut Sheep |
| Abstrak: |
| Domba Garut merupakan domba yang memiliki sifat prolifik. Sekumpulan faktor pertumbuhan yang bekerja pada oosit dan sel-sel folikel ovarium dikelompokkan sebagai oocyted-derived growth factor (ODGF) yang kemudian dikenal sebagai Tansforming Growth Factor ? (TGF?). Tiga faktor anggota TGF? yang dianggap sebagai major gene bagi sifat prolifik adalah Bone Morphogenetic Protein Receptor IB (BMPR-IB), Bone Morphogenetic Protein 15 (BMP15) dan Growth Differentiation Factor 9 (GDF9). Pada penelitian ini dilakukan identifikasi mutasi dari dua gen anggota TGF?, yaitu mutasi titik pada ekson 6 gen BMPR-IB dan mutasi titik pada ekson 2 gen BMP15. Komposisi genotipe untuk gen BMPR-IR pada domba garut galur subur adalah BB (11%), B- (69%), dan — (20%), dan frekuensi alel B (tipe mutan) sebesar 46% dan alel – (tipe liar) sebesar 54%. Sedangkan komposisi genotipe gen BMP 15 adalah 100% untuk ++. Dengan kata lain, pada populasi domba garut tidak ditemukan adanya mutasi titik tipe Galway pada gen BMP15. Deteksi mutasi lebih lanjut pada ekson 2 gen BMP 15 dengan metode SSCP menemukan adanya 4 tipe mutasi, yang diberi kode A, B, C dan D. Semua genotipe yang berhasil dideteksi, baik sebagai gen tunggal maupun kedua gen dikombinasikan, tidak berkorelasi dengan jumlah anak per kelahiran. |
| Abstract: |
| Garut sheep is prolific sheep breed. A group of growth factor that is especially expressed in oocyte and ovarian follicle is grouped as oocyted-derived growth factor (ODGF). Further we also known as the Tansforming Growth Factor ? (TGF?). Proliferation in sheep controlled by three main factor of TGF?, Bone Morphogenetic Protein Receptor IB (BMPR-IB), Bone Morphogenetic Protein 15 (BMP15) and Growth Differentiation Factor 9 (GDF9). Mutations identification in the 6th exon of BMPR-IB gene and 2nd exon of BMP15 gene was done in this research. Genotype composition of BMPR-IB gene in prolific Garut sheep consist of BB (11%), B- (69%), and – (20%). Allele frequency of B allele (mutant type) was 46% and — allele (wild type) was 54%. Genotype composition of BMP15 gene was ++ (100%). These implied that there was no Galway mutation in BMP15 gene. Further detection of mutation on the 2nd exon of BMP15 gene with SSCP method finding four type of mutation: A, B, C, D. All genotype had successfully detected; either as single or combined gene; finding suggestion that there was no correlation between gene and litter size. |
[ Skripsi Lengkap – fulltext ]